В проекте их представлено 50. Они восстановлены за последние несколько лет и представляют собой коллекции по таким направлениям, как этнография, археология, мебель, изобразительное искусство, иконы. В Алтайском крае нет реставрационных мастерских, поэтому реликвии отправляли в Москву, Санкт-Петербург, Омск и Томск. Чтобы посетители смогли наглядно оценить результаты работы, экспозиция дополнена фотографиями этих же предметов до реставрации.
В музее обращают особое внимание на военно-историческую коллекцию, которая пострадала в ходе пожара 2018 года. Так, суконная шинель бойца находилась в удручающем состоянии и была загрязнена расплавленным пластиком, который пролился на неё с потолка. Московские реставраторы впервые имели дело с таким повреждением и даже разработали новую методику восстановления.