В структуре алтайской таможни сейчас работает 340 человек. Служба объединяет восемь постов в двух регионах – Алтайском крае и Республике Алтай. Алтайский край граничит с Республикой Казахстан, на территории региона три автомобильных пункта пропуска. Из Республики Алтай ведёт путь в Монголию. Вблизи границ сотрудники таможни ведут круглосуточное дежурство.
Из сотрудников таможни сформированы мобильные группы. Они проверяют грузы, которые ввозят на территорию России, и всё, что вывозят из страны. В последнее время список запрещённых к вывозу товаров расширился.
Случаются иногда неожиданные находки: недавно пресекли попытку вывоза части туши убитого бурого медведя и ввоза более 2000 упаковок поддельных конструкторов «Лего».